Cambiar de tonalidad una pieza (transportarla) con MuseScore es muy sencillo. Vamos a cambiar nuestra pieza a la tonalidad de Sol Mayor. Seleccionamos todo en el menú:

Edit > Seleccionar todo

Y transportamos con el menú:

Notas > Transposición...

En la casilla de semitonos introducimos 2, ya que la pieza está en Fa Mayor y queremos subirla 1 tono. Marcamos la casilla Transponer las armaduras y pinchamos en Aceptar. El resultado será el siguiente: